Desde Puerto Natales se puede embarcar en el Ferry Magallanes, el que en un crucero de 5 días le llevará a través de los fiordos de la Patagonia Chilena hasta la ciudad de Puerto Montt en la X región del país, donde se podrá continuar el viaje por Chile. Otro buque que se puede abordar en Puerto Natales es el Skorpios, un crucero de lujo que en 4 días de navegación haciendo su travesía por canales que le sorprenderá la naturaleza sin explotar la cual le llevará hasta el Glaciar Pío XI en el Parque Nacional Bernardo O’Higgins.